{{news.content}}
{{news.date}}
{{news.section.name}}
Сотрудники Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН научились по-новому выявлять РНК гриппа H1N1 и SARS-CoV-2. Этот метод быстрее ПЦР-теста и не требует дорогого оборудования, сообщает издание «Наука в Сибири».
РНК-содержащие вирусы провоцируют множество инфекционных заболеваний. Это, например, грипп А или новая коронавирусная инфекция. При этом важно обнаружить вирус у заражённого как можно раньше, чтобы болезнь прошла без осложнений. Необходима быстрая диагностика ещё во время инкубационного периода, чтобы вовремя начать лечение и не дать пациенту заразить других людей.
Часто вирус находят с помощью полимеразной цепной реакции — ПЦР. У пациента берут мазок, и во время анализа в пробирке во много раз увеличивают РНК вируса. Если она, конечно, есть в образце. Тогда можно судить, болен человек или здоров. На такой тест уходит 1,5-3 часа, и для него нужно дорогое оборудование.
А вот для изотермической амплификации — то есть увеличения — потребуется температура в 37 градусов. Дорогие установки для такого анализа не нужны, а сделать его можно всего за час.
Один из видов изотермической амплификации — NASBA (Nucleic Acid Sequence-Based Amplification). Он многократно увеличивает концентрацию РНК, и это помогает подтвердить или исключить наличие вируса в пробе пациента даже в спорных случаях, когда возбудителя болезни в мазке так мало, что ПЦР может его не обнаружить. NASBA можно использовать, если болезнь протекает бессимптомно.
Новосибирские биологи разработали комбинацию NASBA и Cas13a — белка, который узнаёт и расщепляет определённые фрагменты РНК. Достоверность метода подтвердили на вирусе гриппа А и коронавирусе.
«Детекция состоит из двух этапов. Первый — изотермическая амплификация NASBA — позволяет получить огромную концентрацию фрагмента РНК вируса, а второй — подтвердить, что это именно тот самый фрагмент, расщепить его и получить детектируемый сигнал. При этом детектируемый сигнал возникает за счёт неспецифической активности белка, запускаемой после расщепления целевого фрагмента», — рассказал младший научный сотрудник лаборатории геномного редактирования Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Денис Антропов.
Он пояснил, что в реакции есть специально подобранная сторонняя рибонуклеиновая кислота, меченная органическим соединением — флюорофором. Когда она расщепляется, пробирка с вирусной РНК начинает светиться.
С начала пандемии, по данным регионального оперштаба, в Новосибирской области сделали 676 263 теста на коронавирусную инфекцию. Это позволило подтвердить ковид у 16 581 пациента.
