В 2010 году «Горводоканал» впервые внедрил в Новосибирске систему обеззараживания питьевой воды ультрафиолетовым облучением, что значительно снизило в ней дозу хлора. По данным мониторинга, санитарно-химические показатели воды улучшаются с каждым годом.
Крупнейший водопользователь Новосибирска – МУП «Горводоканал» - уступает по мощности систем водоснабжения и водоотведения только Москве и Санкт-Петербургу. По трубопроводам подземной прокладки, диаметр которых достигает 1200 мм, а общая протяженность – чуть меньше 2000 км, ежесуточно прокачивается 650-700 тысяч кубометров воды. Основным источником хозяйственно-питьевого водоснабжения является река Обь, которая полностью обеспечивает потребности города в воде. Как рассказали в Новосибирском городском комитете охраны окружающей среды и природных ресурсов, очистку речной воды в Новосибирске осуществляют три насосно-фильтровальные станции, на которых применяется единая схема водоподготовки: фильтрационная очистка с коагуляцией, флокуляцией, двухступенчатым обеззараживанием хлорсодержащими веществами и ультрафиолетовым облучением (УФО). В 2010 году на НФС-1 в Новосибирске была внедрена система УФО производительностью 350 тыс. куб. м/сутки. В июне 2013 года такую технологию ввели на НФС-5 (производительностью 500 тыс. куб. м/сутки). Внедрение систем обеззараживания ультрафиолетвым излучением повысило барьерную функцию очистных сооружений по отношению к бактериальному и вирусному загрязнению, снизило дозы хлора, уменьшило образование хлорорганических соединений в питьевой воде. Для пролонгирования и усиления бактерицидной активности хлорсодержащих реагентов в теплый период года на станциях водоподготовки внедряется аммонизация. Кроме того, контролируется изменчивость качества забираемой из Оби воды в разные сезоны года. За качеством питьевой воды, подаваемой абонентам МУП г. Новосибирска «Горводоканал», следит ведомственная Центральная химико-бактериологическая лабораториия. По оценкам экспертов, по большинству показателей продукция предприятия значительно превосходит российские и международные стандарты. По данным мониторинга специалистов Роспотребнадзора, качественные показатели питьевой воды в Новосибирске в 2014 году значительно улучшились по санитарно-химическим показателям по отношению к прошлому году. Ежесуточно от Новосибирска, Бердска, Оби и других близлежащих поселков отводится 550-600 тыс. куб. м сточных вод. В системе водоотведения задействованы 54 автоматизированные канализационные насосные станции и 1400 км внутриквартальных и магистральных коллекторов. Стоки уходят на крупнейшие за Уралом очистные сооружения полной биологической очистки, которые очищают воду от песка, взвешенных веществ и растворенных органических загрязнений. В процессе очистки образуется до 6 тысяч куб. м. осадков в сутки. Они проходят стадии уплотнения, фильтрации и обезвреживания, после чего размещаются на площадках для хранения. Биологические методы очистки позволяют сохранить в осадке ценные биогенные элементы, поэтому он в последующем пригоден для применения в качестве органического удобрения. В 2014 году была на МУП «Горводоканал» была разработана и утверждена инвестиционная программа «Развитие систем водоснабжения и водоотведения» на 2015-2019 годы.